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Registros recuperados : 16 | |
4. | | GALVÃO, A. T.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; LEGUIZÁMON, G. O. C.; ZORZATTO, C.; ALMEIDA, M. C. C. de. Identificação precoce de híbridos de Brachiaria humidicola pela técnica de RAPD. In: SEMINÁRIO INTERNO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 3.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO STRICTO SENSU, 1., 2008, Campo Grande, MS. [Anais...]. Campo Grande, MS: Ed. da UNIDERP, 2008. 4 p. 1 CD-ROM. Trabalho NCBAT3. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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5. | | FARIA, M. A. de; MELLO, M. V.; CHIARI, L.; JANK, L.; ZORZATTO, C.; LEGUIZAMONN, G. O. C. Identificação de acessos de Panicum maximum utilizando marcadores RAPD. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 2., 2006, Campo Grande, MS. Anais [da]... 2. ed. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2006. 1 p. 1 CD-ROM. CNPGC. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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6. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; LEGUIZÁMON, G. O. C.; SALGADO, L. R.; VALLE, C. B. do; PAGLIARINI, M. S. Busca de marcadores moleculares RAPD ligados à apomixia em Brachiaria humidicola. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 3., 2007, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2007. p. 23 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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7. | | LOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; ZORZATTO, C.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CHESTER, M.; VICCINI, L. F. Development of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species. Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4911-4915, 2020 Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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8. | | CHIARI, L.; GALVÃO, A. R. T.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C.; ZORZATTO, C.; ALMEIDA, M. C. C. de. Genetic diversity and early identification of Brachiaria humidicola, hybrids by molecular markers. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 40. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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9. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C.; GALVÃO, A. R. T.; ALMEIDA, C. C. M.; SCHUSTER, I.; PAGLIARINI, M. S. Identificação de marcadores moleculares ligados à apomixia em Brachiaria humidicola. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. 1 p. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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10. | | GALVÃO, A. R. T.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; ZORZATTO, C.; ALMEIDA, C. C. M.; LEGUIZAMON, G. O. de C. Identificação precoce de híbridos de Brachiaria humidicola pela técnica de RAPD In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. 1 p. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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11. | | CHIARI, L.; ZORZATTO, C.; BITENCOURT, G. A.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C.; SCHUSTER, I.; PAGLIARINI, M. S. Identification of a molecular marker linked to apomixis in Brachiaria humidicola (Poaceae). In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON THE MOLECULAR BREEDING OF FORAGE AND TURF: MBFT, 2010, 6., 2010, Buenos Aires. [Resumos...]. Buenos Aires: Ediciones INTA, 2010. p. 180 Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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12. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; BITENCOURT, G. de A.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C.; SCHUSTER, I.; PAGLIARINI, M. S. Identification of a molecular marker linked to apomixis in Brachiaria humidicola (Poaceae) Plant Breeding, v. 129, n. 6, p. 734-736, 2010. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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13. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; LEGUIZÁMON, G. O. de C.; BITENCOURT, G. de A.; ARCE, A.; VALLE, C. B. do; PAGLIARINI, M. S. Busca de marcadores moleculares RAPD ligados à apomixia em Brachiaria humidicola. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE MELHORAMENTO DE FORRAGEIRAS, 2007, Campo Grande, MS. Palestras_resumos [do]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2007. 3 p. 1 CD-ROM. CNPGC. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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14. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; LEGUIZÁMON, G. O. de C.; JANK, L.; RESENDE, R. M. S.; PAGLIARINI, M. S. Search of RAPD molecular markers linked to apomixis in Brachiaria humidicola. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE REPRODUÇÃO SEXUAL EM PLANTAS, 20., 2008, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 240 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 259). Capa e conteúdo em inglês. Título em inglês: XX International Congress on Sexual Plant Reproduction. p. 211-213 CNPGC. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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15. | | ALMEIDA, M. C. C.; CHIARI, L.; GALVÃO, A. R. T.; ZORZATTO, C.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C. Seleção assistida por marcadores moleculares para apomixia em híbridos de Braquiaria humidicola. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. 2 p. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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16. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; MELLO, M. V. de; FARIA, M. A. de; ROCHA, M. da; LEGUIZÁMON, G. O. C. Variabilidade genética de acessos de Brachiaria dictyoneura utilizando RAPD. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 2., 2006, Campo Grande, MS. Anais [da]... 2. ed. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2006. 1 p. 1 CD-ROM. CNPGC. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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Registros recuperados : 16 | |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
11/08/2021 |
Data da última atualização: |
11/08/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 2 |
Autoria: |
LOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; ZORZATTO, C.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CHESTER, M.; VICCINI, L. F. |
Afiliação: |
JULIANA MAINENTI LEAL LOPES, Universidade Federal de Juiz de Fora; ELYABE MONTEIRO DE MATOS, Universidade Federal de Juiz de Fora; CRISTIANE ZORZATTO, Universidade Federal de Juiz de Fora; ANA LUISA SOUSA AZEVEDO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MICHAEL CHESTER, Royal Botanic Gardens; LYDERSON FACIO VICCINI, Universidade Federal de Juiz de Fora. |
Título: |
Development of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4911-4915, 2020 |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-020-05445-z |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Microsatellite primers were developed in Lippia alba complex to better understanding the origins and evolution of the species. We sought to increase the numbers of available simple sequence repeat (SSR) markers. We performed low-coverage (~ twofold) genomic DNA sequencing of a diploid accession and generated a de novo assembly comprising 175,572 contigs. Sixteen SSR loci were selected and of these 13 SSR loci were successfully amplified in 20 L. alba tetraploid accessions and in 12 other Lippia species. Only one SSR locus was monomorphic, whereas 12 loci were polymorphic, yielding one to nine alleles. The heterozygosity was similar among markers, with values of 0.274?0.485; the polymorphism information content values varied from 0.237 to 0.367. These markers were successfully amplified in related species with 85% of transferability on average. Thus, we demonstrate the utility of including a de novo assembly step to obtain SSR markers from low-coverage genomic datasets. |
Palavras-Chave: |
Simple sequence repeat; SSR. |
Thesagro: |
Genética; Marcador Genético. |
Thesaurus NAL: |
Phyla (Verbenaceae); Polyploidy. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 01797naa a2200277 a 4500 001 2133464 005 2021-08-11 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11033-020-05445-z$2DOI 100 1 $aLOPES, J. M. L. 245 $aDevelopment of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aMicrosatellite primers were developed in Lippia alba complex to better understanding the origins and evolution of the species. We sought to increase the numbers of available simple sequence repeat (SSR) markers. We performed low-coverage (~ twofold) genomic DNA sequencing of a diploid accession and generated a de novo assembly comprising 175,572 contigs. Sixteen SSR loci were selected and of these 13 SSR loci were successfully amplified in 20 L. alba tetraploid accessions and in 12 other Lippia species. Only one SSR locus was monomorphic, whereas 12 loci were polymorphic, yielding one to nine alleles. The heterozygosity was similar among markers, with values of 0.274?0.485; the polymorphism information content values varied from 0.237 to 0.367. These markers were successfully amplified in related species with 85% of transferability on average. Thus, we demonstrate the utility of including a de novo assembly step to obtain SSR markers from low-coverage genomic datasets. 650 $aPhyla (Verbenaceae) 650 $aPolyploidy 650 $aGenética 650 $aMarcador Genético 653 $aSimple sequence repeat 653 $aSSR 700 1 $aMATOS, E. M. de 700 1 $aZORZATTO, C. 700 1 $aAZEVEDO, A. L. S. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aCHESTER, M. 700 1 $aVICCINI, L. F. 773 $tMolecular Biology Reports$gv. 47, p. 4911-4915, 2020
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Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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